تأسست كلية الطب عام 2006م وتهتم الكلية بتحقيق الريادة في مختلف مجالاتها: التدريب والتعليم الطبي, والأبحاث الطبية, وتقديم الخدمات الطبية مع التركيز على تلبة احتياجات المجتمع الفلسطيني, وتنطلق رسالة كلية الطب من رسالة الجامعة الإسلامية التي تسعى للنهوض بالمستوى العلمي والثقافي والحضاري, والعمل على مواكبة التطور التكنولوجي, والاتجاهات الحديثة في التعليم العالي وتشجيع البحث العلمي , وتساهم في خدمة المجتمع وبنائه في إطار من القيم والتعاليم الإسلامية.